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    也许你并没有意识到,你身边最亲密的小伙伴其实是微生物。这些小家伙无处不在:土壤中、水中,甚至是我们的身体中。不管你是否愿意,反正它们是挺乐意和你在一起的。皮肤上、口腔内、肠道中,到处都有它们的身影。随着测序技术的发展,微生物组的研究也迎来了新的热潮。追赶这股热潮,你准备好了吗?




    研究策略

    16S扩增子测序
    16S核糖体RNA(rRNA)中的序列变异被广泛用于微生物群体中分类多样性的鉴定。16S序列由9个可变区组成,中间穿插着保守区。利用这种标记,研究人员能够鉴定微生物,而不用对整个基因组测序,显著降低了测序成本。

    鸟枪法测序
    鸟枪法测序,指的是对从微生物群落中提取出的DNA片段进行测序。这种方法代表了完整的细菌基因组,因此几乎不受镶嵌性和偏向的影响。它还包含了更多信息,可对近亲和远亲做出准确的系统发育推断。


    微生物组与健康

    Cell Metabolism:两篇文章教你科学减肥
    Salk生物研究所的科学家们发现,限制进食8-12小时比时不时吃点东西要好得多。这种限时进食(time-restricted eating)能影响肠道菌的平衡,有助于预防甚至逆转肥胖症和二型糖尿病。

    Cell惊人发现:可遗传的微生物组
    伦敦国王学院和康奈尔大学的研究人员通过双胞胎研究鉴定了一种鲜为人知的肠道菌,这种细菌高度可遗传,而且在身材苗条的人体内更为普遍。移植到小鼠体内之后,这种细菌还能避免小鼠发胖。

    颠覆传统观点 胎盘具有独特微生物组
    一项最新研究表明,在健康孕妇的胎盘中,生活着小型却多样化的细菌群落,这颠覆了传统的观点——胎儿生长在一个无菌的环境里。这些细菌大多是“有益细菌”,生活在每个人体内。但是,这项研究也暗示,这种微生物菌落的组成,可能在早产中起一定作用。


    微生物组与疾病

    Cell子刊:肠道菌群是HIV的帮凶
    HIV病毒能够化解机体免疫系统对它们的攻击,Duke大学的一项最新研究表明,肠道的正常微生物在这一过程中起到了关键性的作用。这项研究为HIV的疫苗开发提供了令人耳目一新的重要信息。

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    葡萄牙Gulbenkian研究所(IGC)的研究团队在本期Cell杂志上发表了一项突破性研究,他们发现肠道菌能帮助人体建立抵御疟疾的天然防御机制。

    PNAS:乙肝和肠道微生物组有何联系?
    国立台湾大学医学院Han-Hsuan Chou和Wei-Hung Chien带领的一项新研究表明,肠道微生物组的发展可以解释“为什么婴幼儿往往比成年人更易于患上慢性乙肝”。





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